Shin est né dans une famille fermière, mais très tôt s'est enfui du domaine familial pour se rendre à Kyoto. Là-bas il rencontra un médecin qui le prit sous son aile et lui apprit les bases du métier. En même temps qu'il apprenait la médecine, le jeune garçon se retrouva embrigadé dans une sorte de secte, avec laquelle il restera pendant 10 ans. En tant que médecin, il s'est intéressé à son art occidental et est donc venu à penser qu'il était temps pour le pays de ranger au placard ses traditions pour se moderniser. Partisan de l'empereur, il a rejoint ses rangs pour aider à s'emparer des secrets de l'Ochimizu mais il lui arrive également de se faire passer pour un humble pharmacien itinérant afin de récolter des informations auprès des partisans du Shogun.
Le reste de son histoire est libre tant que ces points sont respectés.
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